Principper for dissektionsmikroskop (stereomikroskop)

Arbejdsprincippet for endissekerende mikroskopafhænger af de to optiske veje, der bruges af mikroskopets objektivlinse og okularer. Hver lysbane giver en anden betragtningsvinkel. De har et toplys til brug under dissektion og et bundlys til at se billeder.
Denne belysning opnås ved at konstruere to okularer (kikkert-stereoskop), der hver viser en anden type lysbane, der hver giver et område til seningskomfort.
Som et digitalt mikroskop kan billeder ses i 3-dimensional vision i realtid på en computerskærm. De giver også mulighed for meget tætte observationer af små prøver såsom insekter, som producerer billeder, der ofte er større end prøvens størrelse, en effekt kendt som makrofotografering. Optag billeder og analyser topografi (overflade) i komplekse prøver i 3D.
Dissektionsmikroskoper bruger to forstørrelsessystemer: fast (primær) forstørrelse, hvor to objektiver giver en vis grad af forstørrelse; og zoom (universel) forstørrelse, som giver kontinuerlig forstørrelse over et variabelt område, med hjælpeobjektiver, der virker til at øge. Den samlede forstørrelse afhænger af visse faktorer. Forskellen mellem zoom og fast forstørrelse kan opnås ved at ændre okularet.
Mellem fast forstørrelse og zoomforstørrelse er et optisk system kaldet Galilean optik, som har faste fokuslinser, der giver en fast forstørrelse til forskellige forstørrelser, såsom to sæt forstørrelser, der giver fire x forstørrelse, tre grupper giver seks gange forstørrelse osv.